子犬は(対立)遺伝子のコピーを父犬、母犬のそれぞれから貰って生まれてきます。　　　 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　下記のDNAマーカー表は、子犬または子孫がそれぞれの両親犬から受け継いだ対立遺伝子をコード化して表にまとめたものです。　　　　　　　　　　　　　　　

この配列を照らし合わせることにより、親子関係の確定または不存在を証明します。

また、両親犬が「病気のクリア証明」と「DNAプロファイル」を取得していれば、その子犬は遺伝子検査をせずに特定の病気がないこと（クリア）が証明されます。血統を証明するにも役立ちます。

上の図式から、子犬がそれぞれの親犬からひとつずつ対立遺伝子を受け継いでいるのがわかります。そのため、この子犬と父犬、母犬の親子関係が確定となります。

AKC（アメリカン･ケネル・クラブ）の報告によると、血統書に記録された情報の約10％に誤りがあるということです。DNA親子鑑定はこのような誤りを改め、正確な血統を維持するとともに親子関係を証明します。プロのブリーダーであれば、誤って不本意な交配が行われたことを察知し、親子鑑定で確認をして、正しい繁殖を続けて行くべきです。